L'activité scientifique se répartit en trois domaines
ou sections:
- La section Edition de textes franciscains largement consacrée
aux textes médiévaux.
- La section Histoire Franciscaine dont le but est de proposer
un large panorama scientifique de l'histoire de la famille franciscaine
par l'intermédiaire de la revue Archivum Franciscanum Historicum
et des collections Analecta Franciscana, Bullarium Franciscanum
et Sinica Franciscana.
- La section de Pensée Franciscaine (philosophique et
théologique) pour la promotion et la coordination de la
recherche dans le secteur de la pensée franciscaine et
de son actualisation.